MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 4242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011984	GAA	2	6	54470	54475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011984	CCTG	2	8	54481	54488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_011984	CGA	2	6	54622	54627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011984	ATC	2	6	54641	54646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011984	CGC	2	6	54675	54680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_011984	TCA	2	6	54789	54794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011984	ACG	2	6	54801	54806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011984	CGA	2	6	54906	54911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011984	CAT	2	6	54924	54929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011984	CAAGGT	2	12	55011	55022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1011	NC_011984	CTG	2	6	55039	55044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011984	GAA	2	6	55176	55181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011984	ACT	2	6	55199	55204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011984	AGG	2	6	55211	55216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011984	CGC	2	6	55372	55377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_011984	ACC	2	6	55382	55387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_011984	AGC	2	6	55395	55400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011984	TTC	2	6	55435	55440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011984	CGA	2	6	55467	55472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011984	GCC	2	6	55581	55586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_011984	CAA	2	6	55722	55727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011984	GGC	2	6	55767	55772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011984	CCG	2	6	55846	55851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_011984	TCG	2	6	56016	56021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1025	NC_011984	CGAC	2	8	56042	56049	25 %	0 %	25 %	50 %	222083194
1026	NC_011984	GCT	2	6	56094	56099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1027	NC_011984	TCG	2	6	56112	56117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1028	NC_011984	GCA	2	6	56151	56156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1029	NC_011984	CAG	2	6	56197	56202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1030	NC_011984	TCT	2	6	56244	56249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083194
1031	NC_011984	TGG	2	6	56250	56255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083194
1032	NC_011984	TTG	2	6	56261	56266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083194
1033	NC_011984	TCGTCC	2	12	56288	56299	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222083194
1034	NC_011984	ATG	2	6	56314	56319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
1035	NC_011984	GAA	2	6	56326	56331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083194
1036	NC_011984	GTTC	2	8	56396	56403	0 %	50 %	25 %	25 %	222083194
1037	NC_011984	GGCCG	2	10	56446	56455	0 %	0 %	60 %	40 %	222083194
1038	NC_011984	TTCC	2	8	56461	56468	0 %	50 %	0 %	50 %	222083194
1039	NC_011984	GCG	2	6	56525	56530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
1040	NC_011984	CGCCTG	2	12	56596	56607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222083194
1041	NC_011984	GGC	2	6	56637	56642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
1042	NC_011984	GCA	2	6	56660	56665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1043	NC_011984	CCT	2	6	56874	56879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083194
1044	NC_011984	TCG	2	6	56903	56908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1045	NC_011984	GGTCGC	2	12	56976	56987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222083194
1046	NC_011984	CGC	2	6	57093	57098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
1047	NC_011984	ACA	2	6	57132	57137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083194
1048	NC_011984	CAT	2	6	57175	57180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083194
1049	NC_011984	CGG	2	6	57183	57188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
1050	NC_011984	GTC	2	6	57232	57237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1051	NC_011984	TGC	2	6	57262	57267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1052	NC_011984	GAT	2	6	57273	57278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
1053	NC_011984	GCGCGA	2	12	57279	57290	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222083194
1054	NC_011984	CCA	2	6	57366	57371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083194
1055	NC_011984	CG	3	6	57375	57380	0 %	0 %	50 %	50 %	222083194
1056	NC_011984	TCG	2	6	57419	57424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1057	NC_011984	TGA	2	6	57438	57443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
1058	NC_011984	CGC	2	6	57491	57496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
1059	NC_011984	GGC	2	6	57498	57503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
1060	NC_011984	CAT	2	6	57511	57516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083194
1061	NC_011984	CGA	3	9	57618	57626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1062	NC_011984	TTCCA	2	10	57865	57874	20 %	40 %	0 %	40 %	222083194
1063	NC_011984	GCC	2	6	58043	58048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083194
1064	NC_011984	GAT	2	6	58084	58089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083194
1065	NC_011984	CAG	2	6	58090	58095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083194
1066	NC_011984	GA	3	6	58115	58120	50 %	0 %	50 %	0 %	222083194
1067	NC_011984	TTGG	2	8	58425	58432	0 %	50 %	50 %	0 %	222083194
1068	NC_011984	AGT	2	6	58575	58580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083195
1069	NC_011984	GCC	2	6	58600	58605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083195
1070	NC_011984	GA	3	6	58654	58659	50 %	0 %	50 %	0 %	222083195
1071	NC_011984	CGG	2	6	58684	58689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083195
1072	NC_011984	GTCG	2	8	58756	58763	0 %	25 %	50 %	25 %	222083195
1073	NC_011984	CCA	2	6	58813	58818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083195
1074	NC_011984	T	6	6	58877	58882	0 %	100 %	0 %	0 %	222083195
1075	NC_011984	CG	3	6	58889	58894	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
1076	NC_011984	CG	3	6	58906	58911	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
1077	NC_011984	CGG	2	6	58922	58927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083195
1078	NC_011984	TGG	2	6	58962	58967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083195
1079	NC_011984	CCGT	2	8	59121	59128	0 %	25 %	25 %	50 %	222083195
1080	NC_011984	CAC	2	6	59164	59169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083195
1081	NC_011984	CGT	2	6	59244	59249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083195
1082	NC_011984	GC	3	6	59290	59295	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
1083	NC_011984	GAG	2	6	59296	59301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083195
1084	NC_011984	TTG	2	6	59425	59430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011984	TCTG	2	8	59456	59463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_011984	TCC	2	6	59510	59515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_011984	GCT	2	6	59555	59560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011984	TG	3	6	59638	59643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011984	GCT	2	6	59787	59792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011984	GCC	2	6	59893	59898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_011984	CTG	2	6	59904	59909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_011984	GT	3	6	59920	59925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011984	TGGC	2	8	59937	59944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_011984	GCA	2	6	60016	60021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011984	CGC	2	6	60169	60174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_011984	CAG	2	6	60210	60215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011984	CG	3	6	60225	60230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_011984	TTAT	2	8	60339	60346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011984	CA	3	6	60371	60376	50 %	0 %	0 %	50 %	222083196
1100	NC_011984	GGC	2	6	60381	60386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1101	NC_011984	TGC	2	6	60439	60444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1102	NC_011984	CGG	2	6	60448	60453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1103	NC_011984	CGA	2	6	60474	60479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1104	NC_011984	GCC	2	6	60542	60547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
1105	NC_011984	GCA	2	6	60560	60565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1106	NC_011984	CCT	2	6	60573	60578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083196
1107	NC_011984	CGGTA	2	10	60595	60604	20 %	20 %	40 %	20 %	222083196
1108	NC_011984	CTG	2	6	60635	60640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1109	NC_011984	GGC	2	6	60661	60666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1110	NC_011984	AAGG	2	8	60674	60681	50 %	0 %	50 %	0 %	222083196
1111	NC_011984	CTT	2	6	60928	60933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083196
1112	NC_011984	GGC	2	6	61054	61059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1113	NC_011984	CGG	2	6	61080	61085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1114	NC_011984	ATC	2	6	61112	61117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083196
1115	NC_011984	CAA	2	6	61132	61137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083196
1116	NC_011984	GGC	2	6	61142	61147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083196
1117	NC_011984	ACG	2	6	61184	61189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1118	NC_011984	GTC	2	6	61203	61208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1119	NC_011984	GCT	2	6	61249	61254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1120	NC_011984	TTC	2	6	61274	61279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083196
1121	NC_011984	GTC	2	6	61368	61373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1122	NC_011984	CGA	2	6	61378	61383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083196
1123	NC_011984	CG	3	6	61400	61405	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
1124	NC_011984	GC	3	6	61436	61441	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
1125	NC_011984	GAA	2	6	61460	61465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083196
1126	NC_011984	CAGCG	2	10	61493	61502	20 %	0 %	40 %	40 %	222083196
1127	NC_011984	GC	3	6	61636	61641	0 %	0 %	50 %	50 %	222083196
1128	NC_011984	GCC	2	6	61652	61657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083196
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1261	NC_011984	GA	3	6	67801	67806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_011984	CGG	2	6	67834	67839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_011984	CTCGAT	2	12	67892	67903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_011984	GAT	2	6	67955	67960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083200
1265	NC_011984	TGC	2	6	68034	68039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083200
1266	NC_011984	GCT	2	6	68058	68063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083200
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1268	NC_011984	TCT	2	6	68210	68215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083200
1269	NC_011984	GTT	2	6	68263	68268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083200
1270	NC_011984	ATCG	2	8	68365	68372	25 %	25 %	25 %	25 %	222083200
1271	NC_011984	GAA	2	6	68419	68424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083200
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1274	NC_011984	TTC	2	6	68542	68547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083200
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1280	NC_011984	CTGGCG	2	12	68707	68718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222083200
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1283	NC_011984	GAT	2	6	68851	68856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083200
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1285	NC_011984	CCTTG	2	10	68992	69001	0 %	40 %	20 %	40 %	222083200
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1292	NC_011984	CG	3	6	69183	69188	0 %	0 %	50 %	50 %	222083201
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1302	NC_011984	GC	3	6	69614	69619	0 %	0 %	50 %	50 %	222083201
1303	NC_011984	TCC	2	6	69673	69678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083202
1304	NC_011984	AGCCC	2	10	69751	69760	20 %	0 %	20 %	60 %	222083202
1305	NC_011984	CG	3	6	69803	69808	0 %	0 %	50 %	50 %	222083202
1306	NC_011984	AAAT	2	8	69828	69835	75 %	25 %	0 %	0 %	222083202
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1322	NC_011984	GATC	2	8	70716	70723	25 %	25 %	25 %	25 %	222083203
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1376	NC_011984	TCT	2	6	73568	73573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083203
1377	NC_011984	TCGA	2	8	73742	73749	25 %	25 %	25 %	25 %	222083203
1378	NC_011984	CGG	2	6	73821	73826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083203
1379	NC_011984	TGA	2	6	73830	73835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083203
1380	NC_011984	GAA	2	6	73837	73842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083203
1381	NC_011984	ACC	2	6	73891	73896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083203
1382	NC_011984	CAG	2	6	73908	73913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083203
1383	NC_011984	TCT	2	6	73931	73936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_011984	CA	3	6	73937	73942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1386	NC_011984	CGC	2	6	74024	74029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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